"Die Rache des Dr. Seltsam"

Skippers Erzfeind Dr. Seltsam ist zurück - große Welteroberungspläne inklusive. Dazu hat Dr. Seltsam Geräte entwickelt, mit deren Hilfe er den Nordpol abschmelzen und so die Menschheit ins Verderben stürzen möchte. Die Pinguine treibt derweil die Sorge um King Julien um, da dieser offenbar entführt wurde. Allerdings wissen die Pinguine nicht, dass Dr. Seltsam dahinter steckt. Und so machen sie sich unwissend auf die Suche nach Julien, wobei in der Höhle des Löwen schließlich gleich zwei böse Überraschungen auf sie warten...

"Flubbi"

Kowalski erfindet durch einen Zufall eine grüne, gallertartige Masse, die er liebevoll Flubbi nennt. Er ist überglücklich, dass ihm endlich ein Geniestreich geglückt ist. Doch falsch gedacht: Flubbi entpuppt sich als gefährliches Monster, das vernichtet werden muss. Erst nachdem Kowalski selbst von seiner Erfindung verspeist wird, erkennt er, dass Flubbi Einhalt geboten werden muss.

"Aus die Maus"

Der Zoo hat wegen einer Sendung im Fernsehen mit einem erheblichem Besucherrückgang zu kämpfen. Er steht kurz vor der Schließung und die Tiere sollen in diverse andere Zoos umgesiedelt werden. Das können sich die Pinguine natürlich nicht gefallen lassen und so setzen sie alles daran, die Schließung zu verhindern.