Nick Fury ist noch immer verschwunden, da taucht der Raketenmann Nova auf. Mit letzter Kraft überreicht er Spider-Man eine Kiste mit unspektakulären Gegenständen: Ein Maßband, eine Parfümflakon und eine Querflöte sollen die Schlüssel sein, um Director Fury zu befreien. Auf der Kiste befindet sich eine Gravur: Sie verweist auf die heilige Stadt der Inhumans - nichtmenschliche Superhelden, die auf der Erde leben. Zusammen mit dem Inhuman Triton macht sich Spidey auf den Weg.

Doc Connors hat eine Anti-Hydra-Waffe gebaut und vertraut Spider-Man den Waffenschlüssel an. Bevor der sich ein passendes Versteck überlegen kann, muss er zu Tante Mays Geburtstagsparty. Da wird der Triskelion von sechs gefährlichen Super-Schurken angegriffen. Doch Spider-Mans Selbstbewusstsein ist angeschlagen: Er befiehlt seiner Spinnen-Truppe den Rückzug.

Peter Parkers Leben ist perfekt: Seine Tante weiß, dass er Spider-Man ist, mit Agent Venom, Iron Spider und den anderen Mitgliedern der S.H.I.E.L.D Academy hat er ein gut funktionierendes Helden-Team zusammengestellt und die meisten Super-Schurken hinter Gitter gebracht. Nur Dr. Octavius ist noch immer frei, aber nicht lange. Spidey kann ihn besiegen und lässt ihn auf den fliegenden Tricarrier bringen. Er ahnt nicht, dass er damit Doc Ocks Pläne unterstützt.

An der Highschool von Peter Parker soll ein Musical über Spider-Man aufgeführt werden. Die Hauptrolle bekommt aber nicht der echte Spinnenmann, sondern Peters verhasster Mitschüler, der Footballstar Flash Thompson. Der läuft in dem Heldenkostüm sogar durch die Stadt und klopft große Sprüche, so dass schließlich ein echter Bösewicht auf der Schulbühne auftaucht.

Hulks Heimweh: Aus den Tiefen des Alls schlägt eine metallene Kugel auf der Erde ein. Der Hulk springt daraus hervor - zusammen mit einem außerirdischen Wesen. Bevor der grüne Riese es zertrümmern kann, wird er infiziert. Nick Fury will den Hulk sicher verwahren, aber Spider-Man schafft seinen Freund aus dem Gefahrenbereich. Da tauchen noch mehr Außerirdische auf... Die Rache des Loki: Spidey hat nicht gefrühstückt, denn er will für die Klassenfotos gut aussehen. Doch sein knurrender Bauch wird ihm zum Verhängnis: Mit einem verzauberten Hot Dog verwandelt Loki ihn in ein Spider-Schwein. Aber das ist noch nicht alles. Jäger aus Asgard tauchen auf und wollen Spidey an den Schinken. Da kann selbst Thor nur bedingt helfen

Horizon High - Teil 1 & 2: Peter Parker gelingt es, an der Horizon High, einer Schule für Genies, aufgenommen zu werden. Nur doof, dass sein bester Freund Harry Osborne gleich wieder von der Schule fliegt. Grund dafür ist eine zerstörte Maschine und der Vorwurf, dass Harry mit der Sache zu tun hat. Wenn dahinter nicht ein intriganter Wissenschaftler und der Geier stecken? Peter muss sich als Spider-Man um diese Dinge kümmern und sich bewähren. Die enge Freundschaft zwischen Harry Osborne und Peter Parker scheint unumstößlich zu sein.

Kidnapping: Der irre Wissenschaftler Octavius hat seine Tentakel modifiziert, kann sein Labor verlassen und macht Jagd auf Spider-Man. Der Nachwuchsheld nimmt seinen Gegner nicht ernst und Dr. Octavius kann Spider-Man kidnappen. Doppelt dumm, denn Spidey hat Director Fury sein Kommunikationsarmband zurückgegeben...

Iron Spider Tony Stark, alias Iron Man, schenkt Spider-Man eine Rüstung, die ihn zu Iron Spider macht. Die High-Tech-Rüstung ist allerdings...

Der Sandman: In New York liegt Schnee und die Schule fällt aus, doch für die Juniorhelden steht ein Winter-Überlebenstraining auf dem Programm. Spidey und seine Kollegen entscheiden sich fürs Schwänzen und düsen zu einer herrlichen Karibikinsel. Doch das Paradies trügt, der Sandman erwartet sie und will sie nicht mehr gehen lassen... Zerstörung: Die Wrecking-Crew demoliert drei Straßenzüge, verschwindet und hinterlässt ein riesiges Chaos. Spiderman ahnt zwar, dass hinter der scheinbar sinnlosen Zerstörungswut mehr steckt, doch Fury hört nicht auf ihn.

"Wie alles begann": Ist es Zufall, dass ausgerechnet Peter Parker von einer radioaktiven Spinne gebissen wurde? Und wie geht er mit seinen neuen Spinnen-Fähigkeiten um? Was hat ein Wrestling-Kampf mit wissenschaftlichen Methoden zu tun? Und wieso kann eine falsche Hypothese doch zur richtigen Schlussfolgerung führen? Antworten lassen sich manchmal nur rückblickend finden.

Captain America gibt den Junior-Helden Unterricht im Kämpfen. Sie haben zwar nicht den Hauch einer Chance, genießen aber die Lehrstunde. Schließlich lässt der erste Avenger seinen Schild bei ihnen, warnt aber, dass diese Waffe kein Spielzeug ist. Natürlich muss Spider-Man den Schild ausprobieren. Dummerweise landet er ausgerechnet vor den Füssen von Dr. Doom.

Dr. Connors Verwandlung: Der Shield-Wissenschaftler Dr. Connors hat beim Absturz des Helicarriers einen Arm verloren. Eigentlich trägt er es mit Fassung, bis er Spider-Man retten will und einen zweiten Arm braucht. Kurzerhand injiziert er sich eine Echsen-DNS, die Dr. Octavius hergestellt hat. Sie lässt seinen verloren Arm wieder wachsen, doch die Verwandlung ist damit nicht abgeschlossen.

Furys Bruder: Der Helicarrier wird erobert, Männer mit Tiermasken übernehmen das Kommando, denn ihr Anführer Scorpio hat eine giftige Rechnung offen mit dem Direktor von SHIELD. Nur gut, dass Spider-Man mal wieder zu spät kommt. Aber gegen die Übermacht braucht er mehr als ein paar witzige Sprüche. Und stimmt es, dass Nick Fury tot ist?

Verdammnis. Fünf unerkannte Helden an einer Schule - Spider-Man, alias Peter Parker, hat es nicht leicht. Vor allem da Sam - besser bekannt als Nova...

Wahre Freunde: Venom ist wieder aufgetaucht und Spider-Man weiß, wer in dem Schlammkörper gefangen ist: Harry Osborn! Er will seinen besten Freund nicht verraten und stellt sich gegen sein Superhelden-Team. Nur gut, dass auch Power Man, Nova, White Tiger und Iron Fist wahre Freunde sind... Dr. Strange: Es kann schon mal passieren, dass Spidey im Unterricht einschläft, aber wieso schlafen auch alle anderen? Und warum sind alle Träume so gruselig?